蛋白質(zhì)的分離純化在生物化學研究應用中使用廣泛，是一項重要的操作技術。 一個典型的真核細胞可以包含數(shù)以千計的不同蛋白質(zhì)，一些含量十分豐富，一些僅含有幾個拷貝。為了研究某一個蛋白質(zhì)，必須先將該蛋白質(zhì)從其他蛋白質(zhì)和非蛋白質(zhì)分子中純化出來。
（1）根據(jù)分子大小不同的分離方法：透析和超過濾（利用蛋白質(zhì)分子不能通過半透膜的性質(zhì)）；密度梯度離心（蛋白質(zhì)在介質(zhì)中離心時質(zhì)量和密度較大的顆粒沉降較快）；凝膠過濾（一種柱層析）
?。?）利用溶解度差別分離：等電點沉淀法（由于蛋白質(zhì)分子在等電點時凈電荷為零，減少了分子間靜電斥力，因而容易聚集沉淀，此時溶解度?。?；鹽溶與鹽析（利用一定濃度鹽溶液增大或減小蛋白質(zhì)的溶解度）
?。?）根據(jù)電荷不同的分離方法，主要包括電泳和離子交換層析分離；
（4）蛋白質(zhì)的選擇吸附分離（利用顆粒吸附力的強弱不同達到分離目的）
（5）根據(jù)配體特性的分離——親和層析（利用蛋白質(zhì)分子與另一種稱為配體的分子能夠特異而非共價地結(jié)合這一生物性質(zhì)）
(6) 低溫有機溶劑沉淀法: 用與水可混溶的有機溶劑，甲醇，乙醇或丙酮，可使多數(shù)蛋白質(zhì)溶解度降低并析出，此法分辨力比鹽析高，但蛋白質(zhì)較易變性，應在低溫下進行。
